多肽的純度通常是通過HPLC，用每分鐘1%的標準乙晴梯度來檢測決定的。合成過程中，氨基酸之間的交聯效率
不是總能達到100%，因而產生一系列的氨基酸缺失的雜質。大多數這樣的氨基酸缺失的雜質在純化過程中都被去
掉了，但有少數的雜質其色譜表現與目標多肽很相近。這些氨基酸缺失的雜質肽留在了多肽樣品中就構成了余下的
幾個百分。